師匠の願いをもとに魔法文明が結実した帝都へ、魔法使い・フリーレンが足を踏み入れる。水面下ではゼーリエ暗殺計画が進み、護衛に動く大陸魔法協会と、帝都を守る魔導特務隊の理念と矜恃が対峙する。英雄たちの思惑が交叉し、物語は仄暗い影に覆われていく後日譚ファンタジー。